Erste gesicherte Nachrichten über die Existenz einer Schule in Mainflingen datieren aus dem 17. Jahrhundert. Der heutige Bau mit seinem markanten Turm entstand in den Jahren 1904/05.
So feierte die Schulgemeinde im Juni 2005 ein großes Fest zum 100jährigen Bestehen.
Genau 33962 Mark kostete seinerzeit der Bau der Schule. In den vier Klassenräumen des Hauptgebäudes tummelten sich 178 Kinder des Eröffnungsjahrgangs.
Nach Wiederaufnahme des Unterrichts nach dem Zweiten Weltkrieg am 1.September 1945 war die Enge noch größer. Zwei Lehrkräfte kümmerten sich in zwei Klassen um 199 (!) Kinder.
Im Schuljahr 1949/50 wurde das Gebäude um eine wirtschaftliche Berufsschule erweitert, die mit Keller und Toilette 41682,28 Mark kostete.
Heute befinden sich verschiedene Fachräume wie PC-Raum,
Kreativ-, Experimentier- und Musikraum, Spielezimmer und Bibliothek dort. 228 Kinder wurden damals unterrichtet.
1951 erhielt die Schule eine Klingelanlage und Warmwasserheizung.
Anfang der 60er Jahre gab es mehrfach Baumaßnahmen. Das Dach wurde mit Schiefer bedeckt, Sportgeräte auf dem Hof wurden montiert, der Treppenflur erhielt neue Fließen, der Südeingang erhielt ein Schutzdach.
Im 2. Stock wohnte bis 1961 eine Lehrerin. Nach ihrem Wegzug wurden die Räume für die Schule nutzbar – als Sportzimmer, Kartenraum, Lehrerbücherei und Lehrerzimmer. 1963 wurde ein Klassenraum im 2. Stock eingerichtet, die Klassenräume erhielten Wasseranschlüsse. Den Schulhof pflasterte man 1969.
1968 wurden die 5. bis 9. Klassen nach Kleinwelzheim in die Mittelpunktschule verlegt. So besuchten ab diesem Zeitpunkt nur noch Erst- bis Viertklässler die Grundschule.
1975 benannte sich die Schule nach der Psychoanalytikerin Anna-Freud.
Die Raumnot blieb treuer Begleiter. 1989 wurde ein Pavillon für zwei Klassen errichtet. Zeitweise musste eine Klasse im damaligen Feuerwehrhaus unterrichtet werden. 1992/93 gab es auf der Sportwiese ein Anbau mit zwei Klassenzimmern.
Der Bau der Turnhalle erfolgte 2006/2007. Am 14.6.2007 wurde die Einfeldturnhalle eingeweiht und machte Platz für einen weiteren Klassenraum am Schulstandort.
Eine Komplettsanierung der bestehenden Gebäude und des Außengeländes– Beginn 2007 – erforderte das Unterrichten in Containern. 2009 konnten Kinder und Erwachsene eine schöne, neu gestaltete Schule in einem zum Teil denkmalgeschützten Kleid beziehen.
Als bisher letzte Baumaßnahme auf dem Gelände wurde in den Sommerferien 2009 der 1989 errichtete Pavillon abgebaut und der Erweiterungsbau mit den Betreuungs- und zwei Klassenräumen begonnen, der am 1. April 2011 eingeweiht und endgültig bezogen wurde.
Im Schuljahr 2021/22 besuchen 144 Kinder in 8 Klassen die Anna-Freud-Schule, Tendenz steigend.
